Главой государства майя являлся халач уиник, в чьих руках была сосредоточена духовная и светская власть. Он считался полубогом, и его подданные относились к нему с огромным почтением. Власть переходила по наследству, как правило, от отца к старшему сыну, но иногда и к другим членам царствующей семьи. Если наследников по отцовской линии не было, новый правитель мог быть избран государственным советом, который также назначал регента в случае престолонаследия несовершеннолетним. Государственный совет являлся в основном консультативным органом, а право принятия окончательного решения принадлежало халач уинику. Насколько совет мог влиять на его решение в чрезвычайных ситуациях, остается неясным. В состав членов совета входили вожди, упомянутые выше сановники батабы (множественное число на языке майя «батабоб»), наиболее важные жрецы и другие высокопоставленные лица. Вполне вероятно, что большая их часть состояла в родстве с халач уиником, поскольку их не избирали, а он сам назначал их в совет.
Говоря об обществе и политике майя, следует помнить, что мы рассматриваем их не в статичном положении, а в положении, которое до завоевания испанцами менялось на протяжении 1000 или 1500 лет. Разумеется, нам больше известно о более поздних периодах, чем о ранних. Ко времени появления испанцев классический период майя закончился, и они находились под иностранным господством. Как уже отмечалось, правление иностранной династии в Майяпане было столь деспотичным, что в 1441 году майя подняли восстание и сбросили иностранных правителей. После этого Юкатан распался на ряд мелких враждующих между собой государств, у каждого из которых был свой правитель, часто являвшийся тираном. В период, о котором имеются наиболее полные сведения, государства майя находились под контролем презираемых народом иностранных правителей, чья власть опиралась на силу и существовала за счет доходов от налогов, взимаемых с подданных, не желавших их платить. В таких условиях верховные правители были склонны окружать себя родственниками, кровно заинтересованными в сохранении своего доминирующего положения. Правитель обычно являлся главой тесно сплоченной правящей клики, чьи действия мотивировались самосохранением. В золотой век цивилизации майя, за 700 или 800 лет до этого, все, по-видимому, обстояло совершенно иначе.
Батаб являлся очень важным членом государственного совета и жил в столице. Но ему полагалось периодически посещать провинцию, которой он управлял. Во время посещения провинции, где ему оказывались королевские почести, он занимался отправлением правосудия, сбором податей и знакомился в общих чертах с положением дел в подчиненном ему регионе. Повседневные дела находились в ведении местных советов, членов которого правильнее всего назвать старейшинами, ежегодно избиравшими из своего числа председателя. Подобная структура управления во многом напоминала структуру управления средневековыми городами Европы, имевшими мэра и городской совет.
Совет представлял собой гражданское правительство, дела же военные относились к отдельному ведомству. Они находились в ведении военачальника, накома, избираемого или назначаемого (скорее всего, последнее) на трехлетний срок. Существовал также наком, под чьим руководством совершались жертвоприношения. Этот человек, так же как и у ацтеков, разрезал грудь жертвы и вырывал сердце. Вполне вероятно, что одно и то же название употреблялось для исполняющих различные обязанности людей, но также возможно и то, что одно и то же лицо совмещало две эти должности.
Существует некоторая путаница относительно армии майя, которой командовал наком. Как уже упоминалось, демонстрируемая на поле боя дисциплина указывает на то, что армия представляла собой хорошо вымуштрованную силу. По всей видимости, воинов тренировали и натаскивали, но регулярной армии не существовало. Кроме участия в проводимых военных кампаниях, солдаты все остальное время находились дома и работали в своих хозяйствах. Лишь находясь на военной службе, они получали плату за выполнение своих обязанностей. Считается, что каждый здоровый мужчина подлежал призыву на военную службу, но существуют упоминания о солдатах, как о людях, пользовавшихся особым уважением. По всей видимости, существовало нечто вроде формируемого на добровольной основе или путем призыва местного ополчения под командованием офицера, известного как ал холпоп. В случае необходимости ал холпоп и его подчиненные поступали в распоряжение накома. Также, по всей видимости, в более поздние периоды существовали находящиеся под командованием постоянных командиров отряды наемников, носивших название «холканы». Что умеет сири